2.5 冷激蛋白質的結構特征

為更強掌握冷激蛋白質潛在性的微生物作用，剖析其蛋白質的空間布局。將海產品腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質的碳水化合物編碼序列遞交到PSＩPRED預測分析其二級結構，結果見圖4。典型性的冷激蛋白質的二級結構包括五個β伸縮，預測分析獲得的二級結構與這一結果大概相符合，Csp1589和Csp1376二級結構的最后一個β伸縮發(fā)生斷塊，這可能是天冬酰胺預測分析真實度太低而致。

將冷激蛋白質的氨基酸序列遞交SWＩSS-MODEL網址，依據編碼序列相似度及實體模型品質各自選擇1mjc的A鏈、5xv9的A鏈、3i2z的B鏈做為Csp1589、Csp1376和Csp2252的模版模型。隨后，用PROCHECK和verify3D對所建三級實體模型開展品質評定。搭建的腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質三級構造都包括五個反方向平行面的β鏈，其產生了一個桶狀構造，合乎冷激蛋白質的已經知道特點。由拉氏構像圖可看得出，針對Csp1589蛋白質實體模型，碳水化合物處在有益地區(qū)、附加容許地區(qū)、一般容許地區(qū)及其不允許地區(qū)的量分別為88.9%，11.1%，0%和0%。針對Csp1376型蛋白質實體模型，相匹配值各自為92.7%，7.3%，0.0%和0.0%。針對Csp2252型蛋白質實體模型，相匹配值各自為96.1%，3.9%，0.0%和0.0%，碳水化合物所有處在有益地區(qū)和附加容許地區(qū)，實體模型品質不錯。在Ｖerify3D結果中，針對Csp1589、Csp1376和Csp2252實體模型，均分≥0.2的碳水化合物的量分別是和100%，89.86%和100%，均分≥0.2的碳水化合物的量做到80%就覺得蛋白質三級實體模型是符合標準的，因而，以verify3D結果看來，這3個實體模型均具備不錯的品質。

2.6 冷激蛋白質的互作蛋白質及配位融合結構域剖析

運用STRＩNG和COACH網址對腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質開展剖析，獲得如圖所示6所顯示與其說密切功效的蛋白和不確定性的配位融合結構域。針對腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質Csp1589、Csp1376和Csp2252，STRＩNG各自檢驗到5，4，10個與其說相互影響的蛋白質（圖6）。與冷激蛋白質Csp1589存有相互影響的蛋白質是組氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、甲谷丙轉氨酶（ABP75296.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、伴侶蛋白（htpG）。與冷激蛋白質Csp1376存有相互影響的蛋白質是組氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、伴侶蛋白（htpG）。與冷激蛋白質Csp2252存有相互影響的蛋白質是依靠ATP的Clp胰蛋白酶（ABP75948.1）、依靠ATP的Clp胰蛋白酶兼容蛋白質（ClpS）、組氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、組氨酸硫酸銨氨谷丙轉氨酶（hisC）、硫酸銨庚糖異構酶（gmhA）、帶有CBS結構域的蛋白質（ABP76571.1）、氮管控蛋白質PtsN（ABP74443.1）、伴侶蛋白（htpG）。在其中組氨酸蛋白激酶是一個磷酸化組氨酸傳統(tǒng)殘基的訊號傳輸酶大家族，參加組成組份數據信號傳輸系統(tǒng)軟件。組份數據信號傳輸系統(tǒng)軟件能夠磁感應環(huán)境破壞，解決環(huán)境破壞造成的負面影響，研究表明一些組份信號轉導系統(tǒng)軟件參加了病菌的超低溫融入全過程，推斷腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質與體細胞對挫折的融入相關。DNA聚合酶是DNA復制的關鍵酶，冷激蛋白質很有可能與DNA復制相關。冷激蛋白質做為一種伴侶蛋白，很有可能與伴侶蛋白htpG存有競爭關系。從研究結果顯示可推斷相比Csp1589和Csp1376，腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質Csp2252的作用很有可能更加繁雜。在很多主要的生命活動中，蛋白質功能的實行取決于蛋白與配位的相互影響，針對蛋白配位融合結構域的預測分析具備關鍵的實際意義。比如：把小分子水放進目地蛋白質的配位融合結構域，提升配位構像和部位，使之和目地蛋白質有最好的融合功效，就會有很有可能發(fā)覺抑止該蛋白質的化學物質。針對腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質Csp1589、Csp1376和Csp2252，其各自預測分析到2，2，一個概率較高的配位融合結構域（圖6）。

3 結果

冷激蛋白質是分析病菌超低溫融入的重要蛋白質之一。本科學研究取得成功增加了海產品腐壞希瓦氏菌的3個冷激蛋白質遺傳基因，并對其開展生物信息學剖析，得到蛋白質理化性質、構造和作用領域的有關進度。腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質均為親水性的小分子水酸堿性蛋白，皆坐落于細胞核，為非代謝型、非跨膜蛋白，都存有冷激蛋白質獨有的冷休克結構域，存有DNA融合結構域和RNA融合基序（motif），能與單鏈DNA和單鏈RNA融合。腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質Csp1589和Csp1376與大腸埃希菌冷激蛋白質CspA親緣關系較近，很有可能在腐壞希瓦氏菌超低溫融入全過程中起主要功效。冷激蛋白質的二級結構和三級構造均合乎冷激蛋白質大家族的特點，其靠譜的三級實體模型可用作各種各樣連接和藥品靶向治療科學研究。根據蛋白質互作和配位融合結構域的剖析，對其作用有深入的掌握，為事后認證冷激蛋白質在腐壞希瓦氏菌超低溫融入全過程中的作用，及其海產品中腐壞希瓦氏菌冷激蛋白質緩聚劑的挑選打下基礎。