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4種非洲豬瘟核酸檢測(cè)試劑盒性能比較分析

來(lái)源:鄭州天順食品添加劑有限公司 發(fā)布時(shí)間:2021-09-19 12:43:37 關(guān)注: 0 次
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目地:為養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室給予合理的非州豬瘟病毒核苷酸診斷試劑盒挑選計(jì)劃方案。方式:挑選4種非洲豬瘟核苷酸診斷試劑盒,根據(jù)比照梯度方向稀釋液后國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的線形增加、對(duì)低成分時(shí)(20copies/μL)的敏感度、對(duì)以純凈水為樣版時(shí)陽(yáng)性診斷率。結(jié)果:線形增加實(shí)驗(yàn)中,A檢測(cè)試劑盒對(duì)20copies/μL濃度值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)檢驗(yàn)率是100%(3/3),別的檢測(cè)試劑盒對(duì)該濃度值下的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),均未做到100%;低成分敏感度實(shí)驗(yàn)中,A檢測(cè)試劑盒呈陽(yáng)性診斷率為91.67%(44/48),別的生產(chǎn)廠家檢測(cè)試劑盒的診斷率各自為85.42%(41/48)、79.17%(38/48)、58.33%(28/48);陽(yáng)性實(shí)驗(yàn)中,A和B未發(fā)生陽(yáng)性反應(yīng),而C、D檢測(cè)試劑盒各自發(fā)生2、一個(gè)非特異性反映。結(jié)果:歷經(jīng)特性較為,A檢測(cè)試劑盒更合乎養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室針對(duì)高敏感度和低陽(yáng)性的規(guī)定。

非州豬瘟病毒(AfricanSwinefevervirus,ASFV)是一類歷史悠久的病毒感染,早在1921年在非州澳大利亞初次發(fā)覺(jué),迄今大約100年的歷史時(shí)間。非洲豬瘟(Africanswinefever,ASF)就是由非州豬瘟病毒造成的野豬、山豬的一種亞急性、性熱、高寬比接觸動(dòng)物傳染病,全部種類和年紀(jì)的豬均可感柒,患病率和致死率高,可以達(dá)到100%。世界動(dòng)物國(guó)際衛(wèi)生組織將其列入法律規(guī)定匯報(bào)小動(dòng)物病疫,我國(guó)也將其列入一類小動(dòng)物病疫。ASF最開(kāi)始于1921年在非州澳大利亞被發(fā)覺(jué),1957年傳到歐洲地區(qū),1971年傳到亞得里亞海地域和非洲地區(qū),2007年傳到高加索地區(qū),現(xiàn)仍在非州、南撒丁島和高加索地區(qū)時(shí)興,給各國(guó)的養(yǎng)殖行業(yè)產(chǎn)生了極大財(cái)產(chǎn)損失。2018年8月3日,我國(guó)診斷第一例非洲豬瘟疫情,以后持續(xù)擴(kuò)散,2020年4月19日,海南省報(bào)導(dǎo)非洲豬瘟疫情后,在我國(guó)國(guó)內(nèi)31個(gè)省份,已所有發(fā)覺(jué)非洲豬瘟疫情。

現(xiàn)階段還沒(méi)有高效的預(yù)苗對(duì)非洲豬瘟開(kāi)展防治,全國(guó)各地養(yǎng)殖廠需依靠微生物安全防范措施,并建立迅速確診試驗(yàn)室,應(yīng)用高精確的檢查方式 ,對(duì)進(jìn)進(jìn)出養(yǎng)豬廠化學(xué)物質(zhì)開(kāi)展檢測(cè)。該科學(xué)研究致力于根據(jù)對(duì)比不一樣生產(chǎn)廠家的非洲豬瘟核苷酸診斷試劑盒的關(guān)鍵特性,為養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室給予合理的檢測(cè)試劑盒挑選計(jì)劃方案,協(xié)助養(yǎng)豬廠有效挑選檢測(cè)試劑盒,構(gòu)建牢固的微生物檢測(cè)服務(wù)防御,狙擊非洲豬瘟的侵入。

1原材料與方式

1.1檢測(cè)試劑盒與國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

4種商業(yè)化的非州豬瘟病毒即時(shí)瑩光PCR診斷試劑盒,A生產(chǎn)廠家檢測(cè)試劑盒(非預(yù)混型)批號(hào)342020005,B生產(chǎn)廠家檢測(cè)試劑盒(非預(yù)混型)批號(hào)202006,C生產(chǎn)廠家檢測(cè)試劑盒(預(yù)混型)批號(hào)20191118,D生產(chǎn)廠家檢測(cè)試劑盒(預(yù)混型)批號(hào)20200301;B646L遺傳基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)GBW(E)091034(生產(chǎn)批號(hào):2020001)購(gòu)自我國(guó)牧工商集團(tuán)公司有限責(zé)任公司。

1.2實(shí)驗(yàn)儀器

即時(shí)熒光定量PCR儀SLAN-48P購(gòu)自上海市宏石醫(yī)療電子有限責(zé)任公司。

1.3實(shí)驗(yàn)方式

1.3.1線性增加實(shí)驗(yàn)

將B646L遺傳基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)稀釋液至1000copies/μL、100copies/μL、20copies/μL、4copies/μL、0.8copies/μL,共五個(gè)稀釋液度,應(yīng)用4種檢測(cè)試劑盒,依照其使用說(shuō)明配備PCR管理體系,開(kāi)展瑩光PCR檢驗(yàn),每一個(gè)稀釋液度反復(fù)3次,與此同時(shí)設(shè)定陰陽(yáng)性對(duì)照。剖析各檢測(cè)試劑盒對(duì)不一樣梯度方向抗體檢測(cè)Ct值,較為不一樣檢測(cè)試劑盒對(duì)各稀釋液度的診斷率和變異系數(shù)。

1.3.2敏感度實(shí)驗(yàn)

將B646L遺傳基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)稀釋液至20copies/μL,應(yīng)用4種檢測(cè)試劑盒對(duì)稀釋液后的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)開(kāi)展瑩光PCR擴(kuò)增,每一種檢測(cè)試劑盒反復(fù)檢驗(yàn)4八個(gè)孔,統(tǒng)計(jì)分析該拷貝數(shù)下不一樣檢測(cè)試劑盒的診斷率。

1.3.3陽(yáng)性檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)

應(yīng)用純水系統(tǒng)做無(wú)模版陰性對(duì)照,每一種檢測(cè)試劑盒配備46個(gè)陰性反應(yīng),設(shè)定陰陽(yáng)性對(duì)照。統(tǒng)計(jì)分析不一樣檢測(cè)試劑盒發(fā)生陽(yáng)性的頻次,陽(yáng)性幾率最少者為宜。

2結(jié)果與剖析

2.1線性增加結(jié)果

應(yīng)用4種檢測(cè)試劑盒對(duì)稀釋液后的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)開(kāi)展檢查時(shí),4種檢測(cè)試劑盒在1000copies/μL、100copies/μL二種拷貝數(shù)的診斷率均為100%,在拷貝數(shù)稀釋液至20copies/μL時(shí)發(fā)生診斷率的差別:A檢測(cè)試劑盒的患病率為100%(3/3),B實(shí)驗(yàn)試劑:診斷率為33.33%(1/3),C檢測(cè)試劑盒的患病率為33.33%(1/3),D檢測(cè)試劑盒的患病率為66.67%(2/3)。A檢測(cè)試劑盒在20copies/μL的診斷率高過(guò)別的檢測(cè)試劑盒,實(shí)際結(jié)果見(jiàn)表1與表2。

2.2敏感度實(shí)驗(yàn)結(jié)果

應(yīng)用4種檢測(cè)試劑盒對(duì)稀釋液至20copies/μL的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)開(kāi)展檢驗(yàn),數(shù)據(jù)顯示A檢測(cè)試劑盒的診斷率最大為91.67%(44/48),B檢測(cè)試劑盒的診斷率其次為85.42%(41/48),C檢測(cè)試劑盒的患病率為79.17%(38/48),D檢測(cè)試劑盒的患病率為58.33%(28/48),實(shí)際結(jié)果見(jiàn)圖1與表3。

2.3陽(yáng)性檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果

應(yīng)用純凈水做無(wú)模版呈陰性,每一種檢測(cè)試劑盒配備46個(gè)陰性反應(yīng),設(shè)定陰陽(yáng)性對(duì)照,統(tǒng)計(jì)分析不一樣檢測(cè)試劑盒發(fā)生陽(yáng)性(有Ct值且曲線圖不典型性)的頻次,A檢測(cè)試劑盒未檢到呈陽(yáng)性,B檢測(cè)試劑盒未監(jiān)測(cè)到呈陽(yáng)性,C試劑盒檢測(cè)兩個(gè)非特異性陽(yáng)性反應(yīng),D試劑盒檢測(cè)到一個(gè)非特異性陽(yáng)性反應(yīng),實(shí)際結(jié)果見(jiàn)圖2與表4。

3探討

該科學(xué)研究較為了4個(gè)廠家生產(chǎn)的非洲豬瘟核苷酸診斷試劑盒對(duì)B646L遺傳基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的檢驗(yàn)結(jié)果,數(shù)據(jù)顯示:線形增加實(shí)驗(yàn)中,A檢測(cè)試劑盒對(duì)20copies/μL濃度值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)診斷率為100%(3/3),別的檢測(cè)試劑盒對(duì)該濃度值下的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的診斷率均未做到100%;敏感度實(shí)驗(yàn)中,A檢測(cè)試劑盒對(duì)稀釋液至20copies/μL的4八個(gè)反復(fù),診斷率為91.67%(44/48),別的檢測(cè)試劑盒的診斷率各自為85.42%(41/48)、79.17%(38/48)、58.33%(28/48);陽(yáng)性實(shí)驗(yàn)中,A檢測(cè)試劑盒和B檢測(cè)試劑盒,未發(fā)生陽(yáng)性反應(yīng),C、D檢測(cè)試劑盒各自發(fā)生2、一個(gè)特異陽(yáng)性反應(yīng)。綜合性3個(gè)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,A檢測(cè)試劑盒在不一樣稀釋液濃度值下的診斷率、較低濃度的(20copies/μL)的診斷率、陽(yáng)性發(fā)生次數(shù)上領(lǐng)跑別的檢測(cè)試劑盒,更合乎養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室針對(duì)高敏感度和低陽(yáng)性的要求,能夠運(yùn)用于養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室非洲豬瘟病毒的核酸確診。

非州豬瘟病毒對(duì)腐壞、溫度、干躁及消毒液都有著極強(qiáng)的抵抗能力。在合適的蛋白自然環(huán)境下,非州豬瘟病毒可在很大的溫度范圍和pH范疇內(nèi)生存,在血夜、尿、糞中十分平穩(wěn),能長(zhǎng)期生存于經(jīng)生產(chǎn)加工過(guò)的生豬肉產(chǎn)品中。因?yàn)锳SFV在自然環(huán)境中平穩(wěn)、生存時(shí)間長(zhǎng),院內(nèi)感染是防治該病原體的唯一計(jì)劃方案,進(jìn)到養(yǎng)豬廠的化學(xué)物質(zhì)和員工需要開(kāi)展實(shí)行嚴(yán)苛的院內(nèi)感染消洗,并開(kāi)展抗體檢測(cè)。挑選一款敏感度高、陽(yáng)性少的檢測(cè)試劑盒,能極大提高養(yǎng)豬廠院內(nèi)感染堅(jiān)固水平。

檢測(cè)試劑盒的敏感度較低,很有可能與引物設(shè)計(jì)和探頭編碼序列、檢測(cè)試劑盒生產(chǎn)工藝流程有關(guān)。在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)流程中,診斷率稍低除與檢測(cè)試劑盒敏感度相關(guān)外,還很有可能與樣版復(fù)雜性、樣版收集運(yùn)送、樣版核酸提取等多種要素有關(guān);試驗(yàn)室發(fā)生陽(yáng)性,很有可能與檢測(cè)試劑盒不穩(wěn)定、試驗(yàn)室環(huán)境污染、機(jī)器設(shè)備的閥值線設(shè)置等領(lǐng)域有關(guān),養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室必須結(jié)合各領(lǐng)域的要素開(kāi)展分辨,該探討中C、D檢測(cè)試劑盒為預(yù)混放,造成的陽(yáng)性很有可能與實(shí)驗(yàn)試劑預(yù)混后,產(chǎn)生非特異性反映相關(guān)。

該科學(xué)研究?jī)H對(duì)4個(gè)生產(chǎn)廠家實(shí)驗(yàn)試劑某一批號(hào)的檢驗(yàn)工作能力干了簡(jiǎn)略較為剖析,樣本數(shù)比較有限,并無(wú)法意味著各實(shí)驗(yàn)試劑的總體檢驗(yàn)特性,僅當(dāng)做一種檢測(cè)試劑盒核對(duì)計(jì)劃方案,供養(yǎng)豬廠試驗(yàn)室參照,試驗(yàn)室檢驗(yàn)工作能力除與檢測(cè)試劑盒有關(guān)特性有關(guān)外,還必須試驗(yàn)室的使用工作人員嚴(yán)苛遵循規(guī)范操作步驟,實(shí)行嚴(yán)苛的質(zhì)量管理,防止因?qū)嶋H操作緣故引發(fā)的假陰性和陽(yáng)性結(jié)果。

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