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茵陳質(zhì)量標(biāo)志物的預(yù)測(一)

來源:鄭州天順食品添加劑有限公司 發(fā)布時(shí)間:2021-09-22 09:31:29 關(guān)注: 0 次
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根據(jù)中藥材品質(zhì)標(biāo)識物的核心理念,對茵陳成分實(shí)效性、招生數(shù)方式、成份非特異、傳統(tǒng)式作用、傳統(tǒng)式藥效及成分可測性開展了潛在性品質(zhì)標(biāo)識物的預(yù)測分析.根據(jù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)開展成份實(shí)效性剖析,根據(jù)參考文獻(xiàn)融合及數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析對茵陳的招生數(shù)方式、成份非特異、傳統(tǒng)式作用、傳統(tǒng)式藥效及成分可測性開展品質(zhì)標(biāo)識物預(yù)測分析.數(shù)據(jù)顯示,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)得到原兒茶醛、異鼠李素及茵陳黃酮類等13個活力成份,重要靶標(biāo)有AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6等.GO作用聚集剖析獲得GO內(nèi)容1 89兩個,在其中微生物全過程內(nèi)容1 64八個,細(xì)胞組成內(nèi)容8兩個,分子結(jié)構(gòu)作用內(nèi)容16兩個.KEGG通道聚集挑選獲得281條轉(zhuǎn)錄因子(P<0.05),涉及到癌病通道、乙肝及TNF轉(zhuǎn)錄因子等.結(jié)果顯示,融合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和參考文獻(xiàn)剖析得到了茵陳蒿靈A、馬栗樹根素二甲醚、大牛兒烯D、6,7-二叔丁基香豆素和茵陳色原酮可做為茵陳潛在性的品質(zhì)標(biāo)識物。

前言

茵陳為菊科綠色植物濱蒿或茵陳蒿的干躁地面上一部分,具備清熱利濕退黃與清熱去火的作用,關(guān)鍵適用于醫(yī)治新生兒黃疸與尖銳濕疣等病癥。茵陳的主要成分包含有機(jī)物類、黃酮類化合物、多糖類、香豆素類及桂皮醛類等.茵陳的當(dāng)代藥用價(jià)值有退熱、止痛、抗感染、抗病毒治療、抗癌、降血脂、調(diào)血糖、抗骨質(zhì)疏松癥、神經(jīng)系統(tǒng)維護(hù)、調(diào)整新陳代謝及防止老年性癡呆病等各種作用。中藥材品質(zhì)標(biāo)識物(Q-marker)是中藥材質(zhì)量管理的新理念,根據(jù)中藥材傳送與追溯、合理、獨(dú)有、能測和藥方搭配的“五標(biāo)準(zhǔn)”,可創(chuàng)建中藥材全過程質(zhì)量管理及品質(zhì)追溯管理體系,為中藥材質(zhì)量管理給予了新的構(gòu)思.文中根據(jù)Q-marker基礎(chǔ)理論,應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和參考文獻(xiàn)剖析對茵陳潛在性Q-marker開展預(yù)測分析,為總體操縱茵陳的品質(zhì)保證參照根據(jù)。

1數(shù)據(jù)庫查詢和專業(yè)軟件

TCMSP數(shù)據(jù)庫查詢(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),Uniprot數(shù)據(jù)庫查詢(https://www.uniprot.org/),Gene Cards數(shù)據(jù)庫查詢(https://www.genecards.org),線上venn圖(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html),DAVID6.8.0數(shù)據(jù)庫查詢(https://david.ncifcrf.gov/),Omicshare數(shù)據(jù)庫查詢(http://ww.omicshare.com),STRING數(shù)據(jù)庫查詢(https://string-db.org/),Graph Pad Prism 6.0手機(jī)軟件及Gytoscape 3.7.2手機(jī)軟件等。

2方式與Q-marker預(yù)測分析

2.1根據(jù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的茵陳成份實(shí)效性的Q-marker預(yù)測分析

2.1.1茵陳活力化學(xué)成分及靶標(biāo)的挑選

應(yīng)用中藥材系統(tǒng)軟件藥學(xué)數(shù)據(jù)庫查詢和剖析服務(wù)平臺TC-MSP,以“茵陳”為關(guān)鍵字開展成分檢索,以內(nèi)服溶出度(OB)≥30%和類藥效(DL)≥0.18為挑選標(biāo)準(zhǔn),開展茵陳活力化學(xué)成分的挑選,共獲得13種活力成份(見表1)。與此同時(shí),運(yùn)用TCMSP數(shù)據(jù)庫查詢搜集茵陳活力化學(xué)成分的靶點(diǎn)蛋白質(zhì)。依靠Uniprot數(shù)據(jù)庫查詢,將靶點(diǎn)蛋白質(zhì)名字導(dǎo)進(jìn),種群限制為“Human”,查找獲得的全部靶點(diǎn)蛋白質(zhì)校準(zhǔn)Uniprot ID,并獲得靶點(diǎn)蛋白質(zhì)所相對應(yīng)的遺傳基因名。

2.1.2相交遺傳基因的挑選

茵陳的主冶病癥為新生兒黃疸和皮膚濕疹.新生兒黃疸臨床醫(yī)學(xué)常見病有急慢性肝病、肝硬化腹水、膽囊結(jié)石及消化道腫瘤等.以黃疸型肝炎、慢性肝病、慢性乙型肝炎、肝硬化腹水、膽囊結(jié)石、消化道腫瘤和皮膚濕疹為病癥,運(yùn)用Gene Cards數(shù)據(jù)庫查詢搜索之上病癥的遺傳基因,挑選每一種病癥的前300個遺傳基因排序在一起,做為治療藥物的疾病基因,共得到疾病基因1 050個。運(yùn)用線上venn圖,將成份遺傳基因和疾病基因?qū)нM(jìn),獲得相交遺傳基因共8一個,結(jié)果如圖所示1所顯示。

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