近日,中國水產(chǎn)科學(xué)院生物科技研究所在鯉抵御嗜水汽單胞菌感柒的分子結(jié)構(gòu)體制領(lǐng)域獲得重大進(jìn)展,有關(guān)探討畢業(yè)論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)布于水產(chǎn)品類1區(qū)雜志期刊《Aquaculture》(2020年JCR1區(qū),IF=4.242)。該畢業(yè)論文獲得我國要點(diǎn)科研開發(fā)方案(2018YFD0900102)和中國水產(chǎn)科學(xué)院中央級(jí)服務(wù)性科研單位基本上科學(xué)研究業(yè)務(wù)費(fèi)項(xiàng)目資金(2018B003和2020TD24)支助。江炎亮副研究員為論文的第一及通訊作者,許建研究者為一同通訊作者。文章內(nèi)容連接網(wǎng)站地址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
嗜水汽單胞菌是鯉魚養(yǎng)殖中傷害最明顯的病原菌之一??茖W(xué)研究員工對(duì)傳染源和抵抗的鯽魚開展全基因重轉(zhuǎn)錄組測(cè)序并進(jìn)行全基因相關(guān)性分析,精準(zhǔn)定位到八個(gè)與抗病性特性明顯關(guān)系的SNP結(jié)構(gòu)域(圖1),并進(jìn)一步尋找6個(gè)潛在性重要遺傳基因,均為免疫力有關(guān)遺傳基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。八個(gè)明顯關(guān)系的SNP中,有一個(gè)為非同義詞SNP,坐落于遺傳基因trim25的外顯子地區(qū),可引起Trim25蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的更改(圖2),且該遺傳基因在經(jīng)嗜水汽單胞菌感柒后的鯽魚肝臟中明顯上漲表述??茖W(xué)研究結(jié)果顯示鯉在基因水準(zhǔn)上的遺傳性差別影響了其抵御細(xì)菌感染的功能高低,為全基因培育鯉抗病性新品種給予了必不可少的分子結(jié)構(gòu)基本。
圖1. Manhattan 結(jié)果展現(xiàn)圖
圖2. Trim25 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析
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